据了解，福建农林大学与中国水科院长期精诚合作，共同面向国家海洋领域、渔业发展方面重大需求，联合开展科技攻关。根据协议，校院双方将在人才培养、科学研究、学科建设等方面开展交流合作，通过采用聘任兼职教授(研究员)、研究生导师的方式，实现优势学科教师资源共享，探索完善校院联合的人才培养模式和体系，建立健全联合攻关和协同创新机制，共同创建国家级和省级科研平台，努力打造高等学校与科研院所紧密合作的成功典范，共同为国家海洋水产事业发展作出更大贡献。
近年来，福建农林大学高度重视海洋学科建设和海洋科学研究，在2017年6月整合涉海领域的优势团队成立了海洋研究院;2021年11月，学校进一步整合资源，高起点、高标准、高质量成立海洋学院，构建更加健全的海洋人才培养体系和科技创新体系，为海洋强国战略和“海上福建”建设提供了更大的人才、科技与智库支撑。